Сюжет боевика «В тылу врага» повествует о летчиках ВВС США, которым пришлось мимо воли принять участие в разрешении конфликта с Югославией. Лейтенант ВМС США Крис Бернетт уставший от постоянного наблюдения за учениями своих коллег и не имея возможности показать свое мастерство в настоящем бою, подает в отставку. Его разгневанный командир Лесли Рейгарт, считающий пылкого парня не готовым к настоящим боевым действиям, решает послать Бернетта в разведку. Во время полёта Бернетт умудряется сфотографировать то, что не предназначалось для посторонних взглядов, а именно военный лагерь боевиков. Его самолет подстреливают, а катапультировавшийся Бернетт оказывается захвачен во вражеский тыл. Адмирал Рейгарт идет на большие жертвы, главная из которых — его карьера и организовывает спасательную операцию лейтенанта Криса Бернетта, которому предстоит выжить на вражеской территории до приезда своих.